Cell Res：北京基因组所合作揭示 RNA 甲基化调控 R -loop 构成及转录终止

R-loop 是一种由 RNA：DNA 杂合链和核酸 DNA 组合成的特殊核酸骨架，在原核和真核生物生物的真核生物组中会产于普遍且与此相关。R-loop 在很多关键的生物学过程中会发挥作用重要动态，包括染色质去除、mRNA介导、DNA 损伤大修以及真核生物组平稳性等，但其如何被可靠介导的机制尚能不正确。m6A 去除作为信使 RNA 上丰度最高的去除类型，普遍参与哺乳动物的胚胎、抗体、干细胞更新、脂质变异、以及生成和转移等生命过程。然而，现阶段尚能不正确 m6A 是否能作为 R -loop 中会 RNA 混合物的本源特征来介导 R -loop 总体，进而发挥作用各种生物学动态。中会科院北京真核生物组研究课题所杨运桂、任捷与中国人民大学生科院孙前题名一个团队合作研究课题，挖掘出 m6A 能平稳 R-loop 的逐步形成，进而介导真核生物mRNA的有效暂停。这一实践中以《m6A promotes R-loop formation to facilitate transcription termination》为题于 10 月 12 日在线发表于《细胞研究课题》（Cell Research）杂志。研究课题一个团队首先通过斑点分子会杂交和抗体荧光技术，挖掘出敲低 m6A 甲基转移酶 METTL3 非同着减低 R -loop 总体，且该介导作用缺少 METTL3 甲基转移酶活性。随后，一个团队成员利用高效液相色谱重新组建质谱技术，挖掘出相较于线粒体结合的 RNA（caRNA），R-loop 的 RNA 混合物有非常石英砂的 m6A 去除。全面利用基于核酸 DNA 建库的 DNA：RNA 杂合链抗体共沉淀PCRPCR技术（ssDRIP-seq），挖掘出缩水的 R -loop 主要石英砂在mRNA暂停区外，R-loop 推移往往与 m6A 的西南方和去除总体相关。为了探索 m6A 对 R -loop 介导的生物学动态，研究课题一个团队绘制了 RNA 转录mRNA残基的成像图谱，并在 MYC、ACTIN 真核生物上顺利进行多种mRNA活性检验，挖掘出 m6A 促进 R -loop 逐步形成是mRNA暂停阶段的关键步骤，可以避免 RNA 转录的mRNA通读。最后，一个团队成员构建了针对mRNA通读的报告真核生物系统，通过 m6A 去除残基的突变全面证实 m6A 对于 R -loop 逐步形成及mRNA暂停的关键作用。该研究课题挖掘出了 m6A 组蛋白去除的共mRNA介导动态，揭示了 RNA 组蛋白去除对染色质骨架的影响，以及 R-loop 骨架中会的 RNA 混合物被去除后对其自身稳态的介导机制，概述了 m6A 通过平稳 R-loop 而促进mRNA正常暂停的物理现象，为全面研究课题 m6A 与 R-loop 的介导机制和具体来说生物学动态提供了基本的技术和理论模型支撑。该研究课题想得到了中会国科学院战略性一环新材料专项、国家自然科学以及国家重点研发计划等基金捐献。许多现代原文：Xin Yang， Qian-Lan Liu， Wei Xu， et al. m6A promotes R-loop formation to facilitate transcription termination. Cell Research (2019).